Investigación traslacional en microbioma (InTraMic): un área de interés común y creciente en el IMTIB, Hospital Italiano e Instituto Universitario / Translational research in microbiome (InTraMic): an area of common and growing interest at IMTIB, Hospital Italiano and Instituto Universitario

Se estima que aproximadamente 100 trillones de microorganismos (incluidos bacterias, virus y hongos) residen en el intestino humano adulto y que el total del material genético del microbioma es 100 veces superior al del genoma humano. Esta comunidad, conocida como microbioma se adquiere al momento del nacimiento a través de la flora comensal de la piel, vagina y heces de la madre y se mantiene relativamente estable a partir de los dos años desempeñando un papel crítico tanto en el estado de salud como en la enfermedad. El desarrollo de nuevas tecnologías, como los secuenciadores de próxima generación (NGS), permiten actualmente realizar un estudio mucho más preciso de ella que en décadas pasadas cuando se limitaba a su cultivo. Si bien esto ha llevado a un crecimiento exponencial en las publicaciones, los datos sobre las poblaciones Latinoamérica son casi inexistentes. La investigación traslacional en microbioma (InTraMic) es una de las líneas que se desarrollan en el Instituto de Medicina Traslacional e Ingeniería Biomédica (IMTIB). Esta se inició en 2018 con la línea de cáncer colorrectal (CCR) en una colaboración con el Colorectal Cancer Research Group del Leeds Institute of Medical Research en el proyecto Large bowel microbiome disease network: Creation of a proof of principle exemplar in colorectal cancer across three continents. A fines de 2019 se cumplió el objetivo de comprobar la factibilidad de la recolección, envío y análisis de muestras de MBF en 5 continentes, incluyendo muestras provenientes de la Argentina, Chile, India y Vietnam. Luego de haber participado de capacitaciones en Inglaterra, se ha cumplido con el objetivo de la etapa piloto, logrando efectivizar la recolección, envío y análisis metagenómico a partir de la secuenciación de la región V4 del ARNr 16S. En 2019, la línea de enfermedad de hígado graso no alcohólico se sumó a la InTraMic iniciando una caracterización piloto en el marco de una colaboración con el laboratorio Novartis. Los resultados de ese estudio, así como el de cáncer colorrectal, están siendo enviados a publicación. En 2020, con la incorporación de la línea de trasplante alogénico de células progenitoras hematopoyéticas, fue presentado un proyecto para un subsidio del CONICET que ha superado la primera etapa de evaluación. En el presente artículo se brinda una actualización sobre la caracterización taxonómica de microbioma y se describen las líneas de investigación en curso. (AU)

It is estimated that approximately 100 trillion microorganisms (including bacteria, viruses, and fungi) reside in the adult human intestine, and that the total genetic material of the microbiome is 100 times greater than that of the human genome. This community, known as the microbiome, is acquired at birth through the commensal flora of the mother's skin, vagina, and feces and remains relatively stable after two years, playing a critical role in both the state of health and in disease. The development of new technologies, such as next-generation sequencers (NGS), currently allow for a much more precise study of it than in past decades when it was limited to cultivation. Although this has led to exponential growth in publications, data on Latin American populations is almost non-existent. Translational research in microbiome (InTraMic) is one of the lines developed at the Instituto de Medicina Traslacional e Ingeniería Biomédica (IMTIB). This started in 2018 with the Colorectal Cancer Line (CRC) in a collaboration with the Colorectal Cancer Research Group of the Leeds Institute of Medical Research in the project "Large bowel microbiome disease network: Creation of a proof of principle exemplar in colorectal cancer across three continents". At the end of 2019, the objective of verifying the feasibility of collecting, sending and analyzing MBF samples on 5 continents, including samples from Argentina, Chile, India and Vietnam, was met. After having participated in training in England, the objective of the pilot stage has been met, achieving the collection, delivery and metagenomic analysis from the sequencing of the V4 region of the 16S rRNA. In 2019, the non-alcoholic fatty liver disease line joined InTraMic, initiating a pilot characterization in the framework of a collaboration with the Novartis laboratory. The results of that study, as well as that of colorectal cancer, are being published. In 2020, with the incorporation of the allogeneic hematopoietic stem cell transplantation line, a project was presented for a grant from the CONICET that has passed the first stage of evaluation. This article provides an update on the taxonomic characterization of the microbiome and describes the lines of ongoing research. (AU)

Informe de evaluación científica basada en la evidencia disponible: fibrosis quística / Scientific evaluation report based on available evidence: cystic fibrosis

INTRODUCCIÓN: La fibrosis quística (FQ) es la enfermedad autosómica recesiva más frecuente entre las poblaciones caucásicas, con una frecuencia de 1 en 2000 a 3000 nacidos vivos. Esta patología es producida por la mutación del gen que codifica la proteína reguladora de la conductancia transmembrana de la FQ (CFTR), existiendo en la actualidad más de 1.400 mutaciones que pueden determinarla. El defecto de la proteína provoca un trastorno del transporte de cloro y sodio por las células de los epitelios, generándose un gran espesamiento de las secreciones, que daña los epitelios secretores, siendo los principales órganos afectados el pulmón, páncreas, hígado, la piel, el aparato reproductor masculino y otros. Los síntomas y signos habituales de presentación incluyen infección pulmonar persistente, insuficiencia pancreática y niveles elevados de cloruro de sudor. Sin embargo, muchos pacientes presentan síntomas leves o atípicos y los clínicos deben permanecer alertas. No se realiza evaluación de los fármacos descritos, en conformidad con los artículos 6º y 9º del Reglamento que establece el proceso destinado a determinar los diagnósticos y tratamientos de alto costo con Sistema de Protección Financiera, según lo establecido en los artículos 7°y 8° de la ley N°20.850, aprobado por el decreto N°13 de 2017 del Ministerio de Salud. TECNOLOGÍAS SANITARIAS ANALIZADAS: Ivacaftor; combinación Lumacaftor/Ivacaftor, Aztreonam nebulizador. ALTERNATIVAS DISPONIBLES: No existe una cura para la fibrosis quística, pero existen muchos tratamientos que pueden aliviar los síntomas y reducir las complicaciones. Terapia farmacológica: - Antibióticos para tratar y prevenir las infecciones pulmonares. -Medicamentos antiinflamatorios para reducir la hinchazón de las vías respiratorias de los pulmones. -Medicamentos que aflojen la mucosidad para ayudar a expulsarla con la tos, lo cual puede mejorar la función pulmonar. -Medicamentos inhalados llamados broncodilatadores que pueden ayudar a mantener abiertas las vías respiratorias mediante la relajación de los músculos que rodean los bronquios. -Enzimas pancreáticas por vía oral para ayudar a que el tubo digestivo absorba nutrientes. -Para las personas con fibrosis quística que tienen determinadas mutaciones genéticas, los médicos podrían recomendar un nuevo medicamento llamado ivacaftor. Fisioterapia y rehabilitación pulmonar: La fisioterapia y la rehabilitación pulmonar ayudan a ablandar la mucosidad espesa de los pulmones facilitando su expulsión mediante la tos y a mejorar la función pulmonar. Cirugía: Por último, se recomienda en algunos casos tratamiento quirúrgico que pueden variar desde la extracción de pólipos nasales, cirugía intestinal para eliminar la obstrucción hasta el trasplante de pulmón en casos graves. CONCLUSIÓNES: El siguiente informe no continúa en evaluación y, por lo tanto, no conforma parte del informe de evaluación entregado a la comisión de recomendación priorizada, debido a que los tratamientos a evaluar no se encuentran registrados en el país ni tampoco han sido presentados a registro, faltando menos de 1 año para la dictación del próximo decreto.

Causas de cambio de tratamiento en un grupo de pacientes VIH/SIDA cubanos / Causes of change in treatment in a group of HIV/AIDS Cuban patients

La infección por virus de inmunodeficiencia humana (VIH) es uno de los mayores problemas de salud actuales, se estima que más de 40 millones de personas están infectadas en el mundo. Se realizó un estudio descriptivo de corte transversal en 40 pacientes VIH/SIDA pertenecientes al servicio de Medicina del IPK con el propósito de caracterizar las causas del cambio de tratamiento antirretroviral y los tipos de reacciones adversas presentadas con este tratamiento en un grupo de pacientes VIH/SIDA..Los pacientes recibieron diferentes esquemas de antirretrovirales entre los que predominaron los siguientes: 3TC, d4T e Indinavir (57,5 por ciento), seguido de 3TC, AZT e Indinavir (22,5 por ciento). Las causas más frecuentes de cambio de tratamiento fueron las reacciones adversas y la mala adherencia al tratamiento. Entre las personas que están recibiendo terapia contra el VIH, existe una tendencia cada vez más frecuente de abandonar o cambiar la terapia. Las causas de estos cambios y del abandono de las terapias suelen estar relacionadas con los efectos secundarios, la fatiga del tratamiento, la fase de la infección por VIH en que se encuentra el paciente, y factores relativos a su estilo de vida. Las causas más frecuentes de cambio de tratamiento fueron las reacciones adversas, seguidas de la mala adherencia al tratamiento antirretroviral. Las reacciones adversas más frecuentes en el grupo de estudio fueron los vómitos y los trastornos digestivos respectivamente

The HIV virus infection is one of the major current problems of health estimating that more than 40 millions of persons are infected at world level. A cross-sectional and descriptive study was conducted in 40 HIV/AIDS patients from the Tropical Medicine Institute service to characterize the causes of the change in antiretroviruses treatment and the types of adverse reactions related to this treatment in a group of HIV/AIDS patients. Patients received different antiretroviruses schemes with predominance of 3TC, d4T and Indinarir (57,5 percent), followed by 3TC, AZT and Indinavir (22,5 percent). The more frequent causes of change of this treatment were the adverse reactions and a poor adherence to it. Among the persons with therapy HIV there is a more and more frequent trend to give up or to change of therapy. The causes of these changes and the leaving the therapy are related to side effects, treatment fatigue, and the HIV infection phase in patient and relative factors related to the lifestyle. The more frequent causes of the change of treatment were the adverse reactions followed by a poor adherence to antiretroviruses treatment. The more frequent adverse reactions were vomiting and digestive disorders, respectively

Tigeciclina versus vancomycin más aztreonam en el tratamiento de infecciones complicadas de piel y tejidos blandos: Experiencia en Latinoamérica / Tigecycline as effective as vancomycin plus aztreonam in the treatment of complicated skin and skin structure infections: Experience in Latin America

BACKGROUND: Treating complicated skin and skin structure infections (cSSSIs) can be challenging. Tigecycline was compared to vancomycin/aztreonam in patients with cSSSIs in a multinational trial; this article reports on the Latin American (LA) population. METHODS: Patients were randomly assigned to receive tigecycline or vancomycin/ aztreonam. Primary endpoint was clinical cure rate at test-of-cure (TOC). Several secondary endpoints and safety were also assessed. RESULTS: A subtotal of 167 LA patients from the multinational trial (N = 573) received ≥ 1 dose of study drug. At TOC, cure rates were similar between tigecycline and vancomycin/aztreonam in the clinically evaluable population.) Noninferiority of tigecycline could not be demonstrated (insufficient sample sizes). Tigecycline-treated patients had higher incidences of nausea, vomiting, anorexia; vancomycin/aztreonam-treated patients had higher incidences of pruritus and rash. CONCLUSIONS: Efficacy results in the LA population were consistent with the multinational study suggesting that tigecycline is noninferior to vancomycin/aztreonam in treating patients with cSSSI.

INTRODUCCIÓN: El tratamiento de infecciones complicadas de piel y tejidos blandos (ICPTB) puede representar un desafío. Se comparó la eficacia de tigeciclina versus vancomicina/aztreonam en pacientes con ICPTB en un estudio multicéntrico; este artículo se refiere a la experiencia en Latinoamérica (LA). MÉTODO: Se asignaron, en forma randomizada, los pacientes a dos grupos de tratamiento: tigeciclina o vancomicina/aztreonam. La meta a evaluar (outcome) primaria fue la curación clínica, denominada test de curación (TC). Se establecieron, además, metas secundarias y la evaluación de seguridad del fármaco. RESULTADOS: Un subtotal de 167 pacientes procedentes de LA, de un estudio multinacional que incluyó 573 pacientes, recibieron ≥ 1 dosis del fármaco en estudio. Al TC, los porcentajes de curación fueron similares entre tigeciclina y vanco-micina/aztreonam en los pacientes clínicamente evaluables). La no inferioridad de tigeciclina no pudo ser demostrada (tamaño de muestra insuficiente). Los pacientes tratados con tigeciclina tuvieron mayor incidencia de náuseas, vómitos y anorexia; los pacientes que recibieron vancomicina/aztreonam tuvieron mayor incidencia de prurito y rash. CONCLUSIONES: Los resultados de eficacia en LA fueron consistentes con el estudio multinacional sugiriendo que tigeciclina no es inferior a vancomicina/aztreonam en el tratamiento de pacientes con ICPTB.

Occurrence of ESBL & Amp-C beta-lactamases & susceptibility to newer antimicrobial agents in complicated UTI.

BACKGROUND & OBJECTIVE: Production of extended spectrum beta-lactamases (ESBLs) and AmpC beta-lactamases are the most common mechanisms of antimicrobial resistance in Gram negative bacilli. A prospective study was undertaken to know the occurrence of ESBL and AmpC producing strains and their antibiotic susceptibilities to newer agents to guide empirical therapy for complicated urinary tract infections. METHODS: Over a period of five months (January to May 2003), organisms grown in pure culture and in significant numbers from urine sample were identified by standard biochemical tests and antibiotic susceptibility determined by disc diffusion method. Gram-negative bacilli that were resistant to third generation cephalosporins, ciprofloxacin and gentamicin/amikacin were defined as highly drug resistant uropathogens (HDRU). HDRU were further tested for ESBL and AmpC phenotypes. RESULTS: Uropathogens were isolated in significant numbers in 1979 (21.8%) of the total 9,072 samples, of which 438(22.1%) were HDRU. Two hundred and five consecutive HDRU isolates were tested for ESBL production and 36.5 per cent were found to be ESBL producers. The highest positivity was found to be in Klebsiella spp. (51.2%), followed by Escherichia coli (40.2%), Enterobacter aerogenes (33.4%) and Pseudomonas aeruginosa (27.9%). Both ESBL producers and non producers showed a high degree resistance to piperacillin (93.1 and 90.9%), amoxycillin-clavulanic acid (93.4 and 90.9%), aztreonam (79.4 and 78%), cefepime (76.7 and 78%), and ampicillin-sulbactam (76.7 and 70.4%). The most effective antibiotics for ESBL producers were imipenem (8.2% resistance), piperacillin-tazobactam (9.5%) and ceftazidime-clavulanic acid (23.2%). Among ESBL non-producers, piperacillin-tazobactam (31.06%), ceftazidime-clavulanic acid (49.2%) and imipenem (11%) were less effective when compared to ESBL producers. Fifty three piperacillin and piperacillin-tazobactam positive and 20 negative isolates were further tested for AmpC production and found that all 53 positive isolates were also positive by for AmpC beta-lactamase. INTERPRETATION & CONCLUSION: Overall, 22.1 per cent of our isolates were highly drug resistant, and ESBL producers could explain only 36.5 per cent of HDRU in our study. Therefore, we assume that AmpC beta-lactamases are more important in our setting. Based on our finding a test using discs containing piperacillin and piperacillin-tazobactam ( PtPc) disc at a distance of 20 mm would act as a useful screening procedure for AmpC production as AmpC beta-lactamase producers are more susceptible to tazobactam as compared to clavulanic acid.

Carbapenémicos y monobactámicos / Carbapenemics and monobactemics

Se hace una revisión y actualización de los antibióticos del grupo de los carbapenémicos y monobactámicos, se hace énfasis en algunos aspectos como espectro antibacteriano, utilidad clínica, estructura química y otros. Se señalan las diferencias entre los diversos fármacos que conforman estos grupos

Aztreonam-ceftriaxone em infecçöes severas / Aztreonam-ceftriaxone in severe infection

Foram tratados 20 pacientes com infecçöes bacterianas clínica e bacteriologicamente documentadas por germes sensíveis ao aztreonam, num estudo aberto e realizado num único centro, com a combinaçäo ceftriaxone/aztreonam. Foram excluídos pacientes neutropênicos, com insuficiência hepática e em uso de diálise peritoneal ou hemodiálise. Foram tratados 1 septicemia, 1 abscesso intra-abdominal, 1 infecçäo severa do seio maxilar e celulite facial, 11 infecçöes urinárias definidas pelo critério de Kass (mais de 10**5 CFU/ml de lavado broncoalveolar. Ocorreram 17 curas e 3 superinfecçöes por staphylococcus aureus (as 3), todas no grupo de infecçäo pulmonar baixa. Näo foram experimentados efeitos adversos clínicos nem manifestaçöes laboratoriais de toxicidade. O uso da combinaçäo cefriaxone/aztreonam mostrou-se eficicente e, ao contrário de outros estudos, näo foram vistas superinfecçöes por germes gram-negativos

Tratamento de peritonites por bactérias Gram-negativas com aztreonam em pacientes submetidos a diálise peritoneal / Treatment of peritonitis by Gram-negative bacteria with aztreonam in patients submitted to peritoneal dialysis

As peritonites em pacientes submetidos a diálise peritoneal apresentam pior prognóstico quando säo causadas por bactérias Gram-negativas, o que exige um tratamento rápido e com antibióticos de amplo espectro sobre estas bactérias. Analisamos a eficácia de um novo antibiótico monobactâmico, ativo contra a maioria das bactérias aeróbicas Gram-negativas, o aztreonam, no tratamento de peritonites causadas por estas bactérias em 10 pacientes submetidos a diálise peritoneal intermitente e seis pacientes submetidos a diálise peritoneal ambulatorial contínua, todos fazendo diálise com cateter permanente (Tenckhoff). Os microorganismos isolados mais comumente foram Pseudomonas sp. em oito casos (50,0 por cento e Enterobacter sp. em tres casos (18,8 por cento). Após monoterapia com aztreonam, obtivemos cura em 13(81,2 por cento) episódios. Em três destes pacientes, entretanto, a cura só foi obtida após retirada do cateter de Tenckhoff. Nos três casos em que houve falência do tratamento com aztreonam, só se obteve cura após mudança do esquema terapêutico, tendo sido necessária a retirada do cateter em dois casos. Näo foram observados efeitos colaterais significativos devido a administraçäo do aztreonam. Os resultados do presente estudo demonstram a eficácia desta droga para tratamento das peritonites por agentes Gram-negativos em pacientes submetidos a diálise peritoneal

Uso de Aztreonam en infección de prótesis vascular / Aztreonam use in infection of vascular prosthesis

El 27 de noviembre de 1992; se intervino un paciente masculino de 24 años, por herida de arma de fuego a nivel de la región inguinal derecha, con lesión de los vasos ileofemorales. Se le realizó interposición de vena safena. Evolucionando torpidamente, presentando deshicencia de anastomosis por infección, debido a Pseudomona aeruginosa y Enterobacter aglomerans. Fue reintervenido en cuatro oportunidades colocándose prótesis de dacron 8mm. Siendo la última reintervención un bypass extra-anatómico ileofemoral derecho. La infección fué tratada con aztreonam y ceftazidima durante 15 días; con evolución satisfactoria. Egresa del hospital el día 15-02-93; presentando pulsos distales en miembro afecto

Estudo comparativo entre as associaçöes aztreonam/clindamicina e tobramicina/clindamicina no tratamento de infecçöes intra-abdominais / Comparison of aztreonam plus clindamycin with tobramycin plus clindamycin in the treatment of intra-abdominal infections

Este estudo avaliou a atividade do aztreonam (um antibiótico ß-lactâmico com atividade específica contra bactérias Gram-negativas), comparando-a com a da tobramicina, em pacientes hospitalizados com infecçöes intra-abdominais severas causadas por patógenos Gram-negativos isoladamente ou associados a outras bactérias. O estudo incluiu no total 156 pacientes, dos quais 76 receberam aztreonam + clindamicina e 80 foram tratados com tobramicina + clindamicina. Os pacientes foram submetidos a diversos procedimentos cirúrgicos envolvendo a cavidade peritoneal. A avaliaçäo clínica final revelou percentagens semelhantes de resultados satisfatórios: 86,5% nos pacientes tratados com aztreonam e 86.2% no grupo tratado com tobramicina. Entre os pacientes que tiveram maus resultados observou-se que em 50% dos casos as infecçöes eram causadas por Gram-negativos isoladamente ou associados a miciroorganismos Gram-positivos, no grupo tratado com aztreonam; esta percentagem subiu para 82% quando se avaliou o mesmo subgrupo entre os pacientes tratados com tobramicina. A incidência de efeitos adversos e de alteraçöes dos parâmetros laboratoriais näo foi significante e semelhante nos dois grupos. Os resultados deste estudo sugerem que o aztreonam pode ser uma droga eficaz e segura para o tratamento de infecçöes causadas por bactérias Gram-negativas

Aztreonam no tratamento de infecçöes causadas por bacilos Gram-negativos de múltiplas resistências / Astreonam in the treatment of infections caused by Gram-negative bacilli of multiple resistance

Aztreonam é um composto de uma nova classe de agentes Beta-lactâmicos monocíclicos sintéticos com atividade contra a grande maioria das bactérias Gram-negativas, mas nao contra as bactérias Gram-positivas ou anaeróbias. Aztreonam foi usado para tratar 23 pacientes com importantes infeccçoes por germes Gram-negativos. Neste estudo dos 17 homens e seis mulheres, haviam 11 casos de infecçoes urinárias, três de pneumonia, três de meningite e seis com outros locais de infecçao. Noventa por cento das infecçoes foram curadas tanto por critérios clínicos como microbiológicos sem significantes reaçoes adversas ou toxicidade pela droga.

Aztreonam, atividade in vitro frente a bactérias gram-negativas / Aztreonam in vitro activity front a Gram-negative bacteria

Os autores estudaram a atividade in vitro de Aztreonam frente a 560 cepas de Enterobactérias e 83 cepas de bacilos Gram-negativos näo fundamentadores de glicose, 95,89% das Enterobactérias e 77,11% dos näo fermentadores foram sensíveis a Aztreonam

Estudios de Aztreonam en infecciones producidas por bacilos gram negativos aerobicos

Se estudió la eficacia y la tolerancia al Aztreonam en veinte pacientes adultos, de ambos sexos, que sufrían de una infección debida a bacterias gram negativas y aeróbicas, como son la Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Edwarsiella tarda, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis y P. vulgaris. Fue efectivo en combinación con Clindamicina, en sepsis intra-abdominal producida por Bacteroides fragilis; y con Penicilina, en un paciente en cuyo cultivo creció Peptostreptoccoco. Observamos mejoría en las primeras 72 horas, en el 80% de los pacientes; y restablecimiento total en los primeros siete días, en el 65% de los casos